Estrutura organizacional básica:
I – Conselhos de Direção Superior:
- a) Conselho Estadual do Meio Ambiente – CEMA;
- b) Conselho Estadual de Recursos Hídricos – CERH; e
- c) Presidência.
II – Órgãos de Assessoramento:
- a) Gabinete do Presidente;
- b) Assessoria Especial Técnica;
- c) Controle Interno
- d) Núcleo de Contrato, Convênios e Projetos;
- e) Autoridade Julgadora
- f) Núcleo de Conciliação Ambiental;
- g) ASCOM;
- h) Ouvidoria;
- i) Comissão Permanente de Licitação e Pregoeiro;
III – Órgãos de Execução
- a) Diretoria Administrativa e Financeira:
- Divisão de Contabilidade.
- Divisão de Orçamento e Finanças;
- Divisão de Recursos Humanos;
- Divisão de Administrativa;
- Centro de Informática;
- b) Diretoria de Monitoramento e Controle Ambiental:
- Divisão de Fiscalização Ambiental;
- Divisão de Mudanças Climáticas e Prevenção a Queimadas;
- Divisão de Monitoramento e Controle Ambiental;
- Divisão de Educação Ambiental;
- c) Diretoria de Gestão Florestal:
- Divisão de Controle Florestal;
- Divisão de Unidade de Conservação;
- Divisão de Reflorestamento e Crédito Florestal;
- d) Diretoria de Licenciamento e Gestão Ambiental:
- Divisão de Licenciamento Ambiental;
- Divisão de Aquicultura e Gestão de Fauna;
- Divisão de Uso do Solo e Agricultura Familiar; e
- Divisão de Licenciamento Ambiental e Infraestrutura, Indústria e Serviços;
- e) Diretoria de Recursos Hídricos:
- Divisão de Gestão e Planejamento de Recursos Hídricos;
- Divisão de Segurança de Barragens; e
- Divisão de Outorga.